Mi a különbség a lapos fenekű és a kerek fenekű 96 lyukú PCR-lemez között?

Sziasztok laborrajongó kollégák! A 96-lyukú PCR-lemezek szállítójaként az utóbbi időben egy csomó kérdést kapok a lapos - fenekű és a kerek - 96-lyukú PCR-lemezek közötti különbségről. Szóval úgy gondoltam, leülök és megírom ezt a blogot, hogy tisztázzam a dolgokat.

Kezdjük az alapokkal. A 96 lyukú PCR-lemez a molekuláris biológiai laboratóriumok alapvető eleme. A polimeráz láncreakcióhoz (PCR) használják, egy olyan technikához, amely specifikus DNS-szekvenciákat amplifikál. Ezeknek a lemezeknek két fő típusa van: lapos - alsó és kerek - alsó.

Lapos - alsó 96 - Wells PCR lemezek

A lapos fenekű 96 lyukú PCR lemezek olyanok, mint a PCR világ igáslovai. Egyszerű, áttekinthető kialakításuk van. Mindegyik kutak alja sík felülettel rendelkezik, ami rendkívül sokoldalúvá teszi őket.

A lapos fenekű lemezek egyik legnagyobb előnye a különböző észlelési módszerekkel való kompatibilitásuk. Például, ha fluoreszcencia alapú érzékelőrendszert használ, a lapos fenék stabil felületet biztosít a fénynek, hogy egyenletesen kölcsönhatásba lépjen a mintával. Ez azt jelenti, hogy pontosabb és következetesebb eredményeket kap. Olyan ez, mintha egy tökéletesen sima színpad lenne egy előadáshoz; minden csak jobban működik.

Egy másik nagyszerű dolog a lapos fenekű lemezeknél, hogy könnyen pipettázható. A lapos felület egyértelmű célpontot ad, így kisebb a valószínűsége annak, hogy véletlenül kihagyja a kutat, vagy kifröcsköli a mintát. Ez különösen fontos, ha kis mennyiségekkel dolgozik, ami gyakran előfordul a PCR-ben.

A lapos fenekű lemezeknek azonban van néhány hátránya. Általában nagyobb felülettel rendelkeznek a kút alján, mint a kerek fenekű lemezeknél. Ez nagyobb párolgáshoz vezethet a PCR folyamat során, különösen, ha hosszú vagy magas hőmérsékletű protokollt futtat. És ha olyan mintákkal dolgozik, amelyeket a kút aljára kell koncentrálni, előfordulhat, hogy a sík felület nem a legjobb megoldás.

Kerek - alsó 96 - Wells PCR lemezek

A kerek – 96 lyukú – üreges PCR-lemezek viszont más formájúak, ami megvan a maga előnye. Az egyes lyukak lekerekített alja segít a minta legalacsonyabb pontjára koncentrálni.

Ez a koncentrációs hatás nagyon hasznos, ha korlátozott mintamennyiséggel van dolgunk. Biztosítja, hogy minden reagens és DNS közel legyen, ami javíthatja a PCR reakció hatékonyságát. Ez olyan, mintha az összes játékosát egy kis területre terelné a pályán; könnyebben tudnak interakcióba lépni.

A kerek fenekű lemezek felülete is kisebb a kút alján, ami kevesebb párolgást jelent. Ez nagy előny, ha olyan PCR-protokollt futtat, amely hosszú inkubációs időt vagy magas hőmérsékletet igényel. Nem kell annyira aggódnia, hogy a minták kiszáradnak.

A kerek fenekű lemezek azonban nem mentesek a kihívásoktól. Kicsit bonyolultabb lehet a pipettázás, mint a lapos fenekű lemezeknél. Az ívelt felület megnehezíti, hogy a pipettahegy közvetlenül a lyuk aljára kerüljön, és nagyobb a veszélye annak, hogy kifröccsen, vagy teljesen hiányzik a lyuk. Előfordulhat továbbá, hogy egyes érzékelőrendszerek nem működnek olyan jól kerek fenekű lemezekkel, mert a fény nem lép olyan kölcsönhatásba a mintával, mint egy sík felülettel.

Alkalmazások

Most pedig beszéljünk arról, hogy az egyes lemeztípusok hol ragyognak a különböző alkalmazásokban.

Lapos - alsó lemezek

A lapos fenekű lemezek kiválóan alkalmasak olyan alkalmazásokhoz, amelyek pontos számszerűsítést igényelnek. Például a valós idejű PCR-nél, ahol a DNS-amplifikáció mértékét méri, ahogy az történik, a lapos fenék biztosítja, hogy a fluoreszcencia jel konzisztens legyen az összes lyukban. Ez lehetővé teszi a cél DNS pontosabb mennyiségi meghatározását.

Gyakran használják nagy áteresztőképességű szűrésnél is. Mivel könnyen pipettázhatók, és kompatibilisek a legtöbb automatizált folyadékkezelő rendszerrel, gyorsan és hatékonyan beállíthat több PCR-reakciót egyetlen lemezen.

Ha felkeltettük érdeklődésünket96 lyukú hajtogatott PCR lemez, amely egy lapos fenekű lemez típus, összecsukható kialakításával még nagyobb kényelmet nyújt.

Kerek - alsó lemezek

A kerek fenekű lemezek ideálisak olyan alkalmazásokhoz, ahol a mintakoncentráció kulcsfontosságú. Az egysejtű PCR-ben, ahol az egyes sejtekből származó rendkívül kis mennyiségű DNS-sel dolgozik, a kerek fenék segít az összes értékes minta egy helyen tartásában.

Jó választás a párolgásra érzékeny PCR-reakciókhoz is. Például, ha egy hosszú denaturációs lépést tartalmazó PCR protokollt futtat magas hőmérsékleten, egy kerek fenekű lemez segíthet megelőzni a minták kiszáradását.

Költség és elérhetőség

Ami a költségeket illeti, nincs nagy különbség a lapos - fenekű és a kerek - fenekű 96 lyukú PCR lemezek között. Az ár általában jobban függ a lemez márkától, anyagától és minőségétől.

A rendelkezésre állás tekintetében mindkét típus széles körben elérhető a piacon. A lapos fenekű lemezek azonban sokoldalúságuk miatt általánosabbak. De ne aggódjon, ha kerek fenekű lemezekre van szüksége, akkor könnyen megtalálhatja őket.

Ha más PCR fogyóeszközöket is keres, ajánljukPCR 4 - STRIPS TUBEésPCR 12 - STRIPS TUBE, amelyek nagyszerű alternatívák kisebb léptékű PCR-reakciókhoz.

A helyes döntés meghozatala

Tehát hogyan dönti el, hogy melyik tányér a megfelelő a kísérlethez? Nos, mindez az Ön egyedi igényein múlik.

Ha nagy áteresztőképességű kísérletet végez, amely pontos mennyiségi meghatározást igényel, és fluoreszcencia alapú érzékelőrendszert használ, akkor valószínűleg a lapos fenekű lemez a legjobb választás. Másrészt, ha korlátozott mintamennyiséggel dolgozik, és koncentrálnia kell a mintát, vagy ha aggódik a párolgás miatt, egy kerek fenekű lemez megfelelőbb lehet.

Az is jó ötlet, hogy lehetőség szerint végezzen egy kis próbaüzemet mindkét típusú lemezzel. Így láthatja, hogy melyik adja a legjobb eredményt az adott PCR protokollhoz.

Kapcsolatfelvétel a vásárláshoz

Ha érdeklődik 96-lyukú PCR lemezek vagy bármely más PCR fogyóeszköz vásárlása iránt, ne habozzon, lépjen kapcsolatba velünk. Azért vagyunk itt, hogy segítsünk megtalálni a laboratóriumi igényeinek megfelelő termékeket. Akár lapos - fenekű, akár kerek - fenekű lemezekre van szüksége, mi mindent megtalál.

Hivatkozások

• Sambrook, J. és Russell, DW (2001). Molekuláris klónozás: laboratóriumi kézikönyv. Cold Spring Harbor Laboratory Press.
• Dieffenbach, CW és Dveksler, GS (2003). PCR primer: Laboratóriumi kézikönyv. Cold Spring Harbor Laboratory Press.